Согласно указу, в структуру министерства вошли Аппарат (отделы и сектора), Государственная служба автомобильного транспорта, Государственное морское агентство, Государственное агентство гражданской авиации, Служба электронной безопасности, Государственный фонд развития информационных технологий.

Напомним, Министерство транспорта, связи и высоких технологий было создано распоряжением президента Азербайджана Ильхама Алиева от 13 февраля 2017 года.